電影: Megumi Hayashibara

柯南和少年偵探團在參觀一座西多摩市新建的「雙塔摩天大樓」時，意外的發現了黑暗組織成員琴酒（Gin）。之後就發生了命案。 命案還沒結束，共通點是每名死者身邊都會留下一個小酒杯。就在柯南和少年偵探團找尋兇手時，琴酒也得知他正在找的叛徒雪莉將在不久之後參加西多摩雙子大樓的落成典禮，並準備在典禮上把她暗殺。 在會場上，短暫的黑暗又有一人死亡。現場也留下了同樣的小酒杯，暗示兇手和之前的是同一人。就在警方和毛利小五郎追查案件的時候，琴酒引爆了藏在大樓內的炸彈，銷毀了情報，同時將頂樓的柯南一行人陷入了危險...

大阪 京都，正在錄製"皐月杯"百人一首記者會的大阪地標·日賣電視台突然發生爆炸，千鈞一髮之際，急忙趕來的柯南救出了被困在崩塌大樓中的平次與和葉，而另一側，"皐月杯"冠軍在京都屋內遭人殺害，監控器裡所顯示出的是——紅葉...原作中的重要角色，百人一首高中生冠軍，自稱"平次未婚妻"的大岡紅葉，將首次在劇場版中登場，新一和小蘭的關係也將發生變化......

開場由警官驅車追捕兩個搶超市的罪犯，佐藤美和子警官用高超的駕駛技術迫使罪犯的汽車翻車，當問及作案動機時，罪犯吐出在神海島上有「Jolly Roger」。 而柯南他們前往位於太平洋中的美麗小島「神海島」渡假。這座島嶼自古流傳著一則有關於沉沒在海底的古代遺跡「海底宮殿」，以及300年前實際存在的女海盜「安·寶尼」、「瑪麗·麗德」所遺留下來的寶藏傳說。 在毛利小五郎的帶領下，小五郎、小蘭、園子、阿笠博士、少年偵探團一行人來到神海島。小蘭與園子在海底宮殿附近海底潛水，少年偵探團則在玩神海島觀光安排的...

最近發生一連串音樂家遭到殺害的事件，而所有被害者生前都曾在某個知名鋼琴家所舉辦的音樂學校上過課。某日，柯南一行人受邀前往參加這位鋼琴家所興建的音樂廳之落成紀念音樂會，在這場世界著名音樂家雲集的音樂會中，最受矚目的主角是一名天才女歌手，沒想到卻傳出有人企圖暗殺這名女歌手的消息；雖然柯南在千鈞一髮之際出手相救，讓她得以躲過殺手的暗殺，但犯人並未就此放棄，反而將欲殺害的目標轉移到柯南等人身上。犯人的魔掌不斷朝着柯南等人伸出，他這麼做的目的，難道是想要阻撓這場音樂會嗎？ 音樂會當天，柯南在進入會場之前...

小智一行人為了觀看一千年才出現七天的千年彗星，而來到了某處，正好有移動式遊樂園也到了這裡。在遊樂園內，他們認識了魔術師巴特勒與他的助手黛安。在表演中，小勝不時聽到有人在呼喚他的聲音，巴特勒得知後，並告訴他們有關基拉祈的事，同時將沉眠之繭交給他們。傳説當千年彗星造訪地球的時候，只要有心地純真的人當搭檔，基拉祈就能從沉眠之繭中甦醒七天，之後就會再次沉睡。基拉祈具有實現人們願望的能力，表面和善的巴特勒，背地卻想利用基拉祈的力量來達成自己的野心，小智等人有辦法保護基拉祈嗎？在這不可思議的七天七夜裡，一場...

很久以前，在歐魯德朗城曾經爆發一場很嚴重的戰爭，勇者亞朗於是決定藉助世界初始之樹及夢幻的力量來平息戰爭，為了不讓自己的寵物小精靈-路卡利歐跟自己一起犧牲，亞朗於是並將牠封印在權杖內，就這樣過了好幾百年......。小智一行人來到了歐魯德朗城，在這裡正舉辦歌誦勇者亞朗的慶典，他們換上了當地的服裝，小智還在慶典舉辦的比賽中拿到優勝，榮獲勇者亞朗的名號。在當晚，正當大家正沉醉在快樂的舞會時，夢幻卻出現了，並帶走了比卡超和喵喵怪。另一方面，就在舞會要結束時，亞朗權杖上的封印竟解除了，從裡面出現了路卡利歐...

小五郎應京都寺院的邀請，前往京都調查寺內八年前佛像盜竊事件。寺院早前得到佛像下落的線索，是一件有不同圖案的圖畫，提供給小五郎，以便儘快尋回佛像。同時間，東京、大阪和京都發生殺人事件，三個城市的警方調查後，發現事件中的死者都是盜賊團「源氏螢」的成員，毎人都有一個代名，以《義經》內的傳統人物命名。服部亦因此事，前往京都調查殺人事件的真相。期間遇上柯南，兩人一起調查兩宗事件，發現兩宗事件都有共同點，有助解開八年前佛像盜竊事件。在調查期間亦發生殺人案，服部因此而受襲，和葉亦因查找施襲者線索而被人挾持。...

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小智、小霞和小剛接受神祕訓練家之邀，碰上一心對戰的人造寶可夢：超夢。...

鈴木園子的叔叔次郎吉不甘心失敗，決定再次向怪盜基德發出挑戰。這位壞脾氣的大叔斥巨資製造了巨型的飛船貝爾·雪利二世號，並以鑲嵌有名貴寶石「天空的貴婦人」的戒指作賭注，邀請基德前來挑戰，看他能否在東京到大阪的這6小時時間內完成這項困難的任務。柯南、小蘭等人理所當然也接到邀請，甚至電視台的人也興師動眾前來。隨着時間的流逝，雙方的對決悄悄展開。另一方面，恐怖組織紅暹羅貓也登上了飛船。此前不久，紅色暹羅貓襲擊了國立東京微生物研究所，並盜走一種致命的病毒。...

小智一行人來到紐特市，遭遇了蓋諾賽克特作亂破壞的情景，而此時超夢夢出現並阻止蓋諾賽克特。...

位於卡洛斯地區有一座和諧寧靜的地下王國——鑽石王國。調皮可愛的精靈公主蒂安希（松本真理香配音）備受寵愛，然而她似乎並未擁有讓維持著王國運行的神聖鑽石繼續產生能量的能力，為此她在長老的指點下啟程前去尋找傳説中的精靈哲爾尼亞斯（三田佳子配音）。因為擁有製造鑽石的能力，蒂安希在路上遭到了女賊瑪麗蓮（足立梨花配音）、忍者盜賊萊歐特（山寺宏一配音）以及火箭隊三人組的刁難，關鍵時刻多虧小智（松本梨香配音）出手相助才讓她化險為夷。在此之後，公主和小智他們一路同行，幾經輾轉終於來到了哲爾尼亞斯所在的森林。但是，...

由杜勳頓所帶領的海盜集團，在海中取得有「蒼海的王子」之稱的瑪納霏的蛋，企圖用以不法之事。但隨即被從中卧底的寵物小精靈保育家傑克·渥卡所奪走。 之後，小智等人在旅途中因缺乏水源，而與一羣為「水之民」後代的馬戲團家族結識。當晚小遙夢見一座神殿。後經廣美的解説，眾人方知他們正在替傑克保管瑪納霏的蛋，而那神殿正是牠的故鄉，名為亞克夏。 隨後，杜勳頓等人聞訊前來想把蛋搶回。在混亂之中，瑪納霏在小遙手中孵化了。大家便決定將牠送回神殿；而杜勳頓為了得到隱藏在神殿內的寶物「海之王冠」，極需要瑪納霏來替自己找出神...

一天，木之本櫻在雜貨店抽中香港旅行的特等籤。由於父親出差，小櫻帶着基路仔，邀哥哥木之本桃矢和好友大道寺知世、月城雪兔一同前往香港。在香港，小櫻與香港人李小狼、李莓鈴再次相見，十分高興。但小櫻身邊總出現神祕的小鳥，還夢到了奇怪的魔導士。李小狼的母親告訴小櫻，小櫻持有古羅咭將有危險。小櫻產生了奇怪的感覺，打開了店裏的一本書，書中噴出水來。小櫻被水吞入，和夢中的魔導士相見。哥哥和朋友被捉，小櫻以香港爲舞臺和魔導士戰鬥，發現了因古羅·理道而生的悲劇。...

綠色草原，是個能夠使人和寵物小精靈都心境安寧的地方，在這裡住著秀力博士和他的女兒小美，有一天，秀力博士在遺跡裡研究神秘寵物小精靈-未知圖騰的時候，不小心被吸進異次元內，小美十分思念父親，沒想到竟因此喚醒了未知圖騰。未知圖騰將小美的心靈以結晶化呈現，最後更創造出小美最喜歡的傳説寵物小精靈-炎帝，小美因此誤以為爸爸變成炎帝的模樣回來了，炎帝為了實現小美的心願，並充當他的爸爸。小智的媽媽和秀力博士是舊識，因為擔心小美而趕來，在這碰到剛結束對戰來到這裡休息的小智他們。沒想到炎帝卻從結晶塔中出現，將小智的...

在合眾地方旅行的小智、艾莉絲、天桐一行人，來到了被稱為「大地之劍」的塔為中心發展的城市：艾茵多奧克。這裡是由曾經繁榮一時的大地之民所建立的國度，但現在已經沒落。 小智等人為了參加收穫祭對戰大會來到艾茵多奧克，他們在這裡遇到了能給予人或寵物小精靈不可思議力量的夢幻寵物小精靈——比克提尼。大地之民的後裔——德雷多企圖利用比克提尼的魔力讓早已絕跡的古王國重現人間，艾茵多奧克因此陷入前所未有的混亂。 究竟小智一行人能不能拯救陷入危機的城市呢？比克提尼的命運將會如何？伴隨著捷克羅姆、雷希拉姆的謎團，寵物小...

小智一行人抵達了小光預備參加寵物小精靈華麗大賽的白楊鎮，在那裡他們認識了駕駛熱氣球的女子艾莉絲、其青梅竹馬東尼歐，以及艾伯特男爵。由於艾伯特男爵認定隱居於城鎮庭園中的黑暗寵物小精靈-達克萊伊是近日來破壞城鎮的元兇，並準備討伐牠。 然而東尼歐的想法卻不同，他偵測到在白楊鎮的上方有一股異常的衝擊波，而那正是傳説中分別掌控時間的帝牙盧卡與空間的帕路奇犽這兩大傳説中的寵物小精靈在次元夾縫中大戰所造成；而達克萊伊的攻擊正是為了讓牠們遠離這座城鎮。隨著兩大傳説中的寵物小精靈的爭鬥越來越激烈，終於在白楊鎮的名...

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王冠市是個水與綠茵、古街道與近代建築完美調合的城市。為了觀看正在這裡舉辦的「寵物小精靈足籃世界盃」，小智一行人向王冠市前進。在旅途中，小智們與正在尋找媽媽的寵物小精靈「索羅亞」相遇，並一起結伴同行。 就在此時，名為「索羅亞克」的寵物小精靈竟然化身成為雷公、炎帝、水君的模樣，在王冠市的街道上大搞破壞。就連相隔了 20 年再度回到這座城市的雪拉比，也再次面臨了危險。 王冠市到底面臨著什麼樣的危機？幻影的霸者「索羅亞克」的身分究竟是？雪拉比的命運又會如何？小智和比卡超是否能夠解救城裡遭遇危險的寵物小精...

四年前，一顆隕石墜落至極地，從中誕生出 DNA 寵物小精靈-代歐奇希斯，居住在臭氧層的天空寵物小精靈—烈空坐，因而認為代歐奇希斯侵略牠的領域，雙方展開了一場激烈的殊死戰。戰況到了最後，烈空坐原本陷入一面倒的慘況，讓代歐奇希斯鬆懈了下來，沒想到代歐奇希斯卻一時大意，被烈空坐最後的破壞死光消滅，其核心沉到了海裡，倫多博士正好帶著他的助手優子及兒子小超來此地考察，目睹了這一切，並帶走了另一個還留在隕石內沒有復活的代歐奇希斯的核心，但是小超從此變得很害怕寵物小精靈。四年後，小智等人為了挑戰對戰塔，造訪了...